X - XI sec.

Dai dati archeologici rinvenuti si deduce che la prima trasformazione della chiesa ebbe luogo tra il X e l'XI con l'abbattimento della parte orientale dove si trovava l'abside rettangolare. Al suo posto fu incorporato un coro trapezoidale e fu inserito, tra la zona dell'altare e la navata, l'arco trionfale rimasto fino ai nostri giorni. Diversamente da oggi, il coro aveva allora una semplice copertura piana. Anche i celebri affreschi dell'alto medioevo potrebbero risalire a questo periodo di ristrutturazione della chiesa.

Sulla datazione del ciclo gli esperti di storia dell'arte non sono tuttavia concordi. Alcuni ritengono l'opera retrodatabile all'VIII - IX secolo, fino anche al VII sec. Tutti invece concordano nell'attribuire le decorazioni altomedievali della chiesa a due diversi artisti, in quanto lo stile delle pitture murali dell'arco di trionfo si differenziano palesemente da quelle della navata.